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    生物中心在玉米根虫的研究方面取得了突破性进展

    发布日期:2021-02-23 12:57 生物论文

    近日,生物中心年轻人才杨小增和世界顶尖农业公司Corteva Agriculture在我国西部玉米根虫小RNA研究方面取得突破。美国玉米根虫(Diabrotica virgina virgina virgina,又名西方玉米根虫)是北美破坏性最大的农业害虫之一,其年损失按10亿美元计算。该合作系统鉴定和研究了玉米根虫不同发育阶段小RNA的动态变化,揭示了玉米根虫和常见昆虫中微小核糖核酸簇的选择和进化,为研究西方玉米根虫和其他鞘翅目昆虫的小RNA转录组和微小核糖核酸介导的基因调控提供了新的认识。相关论文发表在优秀期刊《基因组学蛋白质组学生物信息学》(中科院1师,影响因子7.051),生物中心为第一通讯单位。

    本研究采用小核糖核酸测序法,鉴定了玉米根虫中101个保守的微小核糖核酸基因和277个特异的微小核糖核酸基因。进一步研究发现,在所有物种中,U都像miRNA的第一碱基一样具有明显的偏好性。即使在西部玉米根虫和北部玉米根虫中,miRNA在两个相似的物种中也有许多变异。

    研究还发现,节肢动物中有20多个miRNA家族高度保守,在不同的进化分支中也有一些特定于这个节点的miRNA。这项工作揭示了大量(超过200个)特异于玉米根虫的mirna,其中大部分表达相对较低,表明它们正在被mirna和靶基因调控机制筛选,而一些高表达的特异mirna已经被固定在调控网络中。

    图2。西方玉米根虫和北方玉米根虫微小核糖核酸及其他物种微小核糖核酸保守性分析

    这项工作的另一个有趣发现是分析节肢动物中一些高度保守的miRNA簇的进化和表达。尽管成员分布和顺序不同,但这些保守的微小核糖核酸簇在不同物种中非常保守。此外,通过表达分析发现,集群的不同成员在不同组织中有相似的表达模式,这表明它们的功能密切相关。

    本研究得到了科迪华公司小RNA重点项目和我校引进青年人才启动资金的支持。年轻有为的杨晓曾关注植物miRNA和作物育种研究。课题组常年招收生物信息学和分子生物学博士后。更多详细信息,请访问研究小组的网站()。如果您有兴趣加入实验室,请将您的简历发送至。推荐信息。


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