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    科学论文解读:SARS-CoV-2尖峰蛋白重复序列缺失导致抗体逃逸

    发布日期:2021-02-07 14:44 生物论文

    他们报告说,因为这些缺失发生在编码尖峰蛋白(S蛋白)形状的DNA序列的一部分上,所以以前的中和抗体不能捕捉病毒。鉴于具有纠正功能的错误聚合酶不能修复SARS-CoV-2复制过程中的缺失,它们会固化成SARS-CoV-2变异体的遗传物质。

    该论文的合著者、匹兹堡大学疫苗医学院研究中心主任保罗杜普瑞斯博士说:“你无法修复那里不存在的东西。一旦消失,就消失了。如果抗体看到的病毒重要部分消失了,那就永远消失了。”

    自从这篇论文在2020年11月作为预印版本首次提交以来,这些研究人员一直在观察这个模型的发展:几个有趣的SARS-CoV-2变体在世界各地迅速传播。首先,在英国和南非发现的SARS-CoV-2变异体有这样的序列缺失。

    Duprex和他的研究小组首先在一名免疫低下患者的样本中发现了这些中和抗性序列的缺失(即中和抗体序列的缺失),该患者已感染SARS-CoV-2病毒74天,最终死于该病毒引起的COVID-19。对于病毒和患者的免疫系统来说,这是一个漫长的“猫鼠”游戏时间,也给了大量的机会开始共同进化,导致这些令人担忧的病毒基因组突变在世界各地发生。

    随后,在论文的共同作者和第一作者、匹兹堡大学医学院微生物学和分子遗传学助理教授、流感病毒专家凯文麦卡锡博士的帮助下,杜普雷克斯观察了该患者病毒中的序列缺失是否是更大趋势的一部分。

    麦卡锡和他的同事查阅了自SARS-CoV-2病毒首次传播到人类以来在世界各地收集的序列数据库。这个研究项目在2020年夏天开始的时候,SARS-CoV-2被认为是比较稳定的,但是麦卡锡更仔细地检查了数据库,他看到了更多的缺失序列,出现了一个模式。这些缺失不断地发生在病毒序列的同一位置,即病毒可以容忍形状变化而不丧失侵入宿主细胞并自我复制的能力的位置。

    麦卡锡说,“进化会重演。通过观察这种模式,我们可以预测。如果发生几次,很有可能再次发生。”

    麦卡锡鉴定的带有这些缺失的病毒序列中,有所谓的英国品种B.1.1.7,此时是2020年10月,B.1.1.7还没有流行起来。其实当时没有命名,只是数据库里有。这种综艺已经出现,但当时没人知道会带来什么影响。但是麦卡锡通过寻找基因序列中的模式提前发现了它。

    谢天谢地,在这位匹兹堡患者身上发现的SARS-CoV-2毒株,仍然很容易被恢复期血浆中的抗体中和,这说明突变逃逸不是全部,也不是全部。在设计针对这种病毒的工具时,了解这一点很重要。

    杜普瑞斯说,“用多种方法对付这种病毒,就是打败它的变种的方法。不同抗体的组合,纳米抗体和抗体的组合,以及不同类型的疫苗。如果出现危机,我们希望有这些备份。”

    虽然这篇论文展示了SARS-CoV-2如何逃脱现有的疫苗和治疗药物,但仍然无法确切知道这种情况何时发生。未来6个月,市场上的新冠肺炎疫苗是否会继续提供高水平的保护?一年?五年?

    麦卡锡说,“这些缺陷会在多大程度上削弱保护,还有待确定。在某种程度上,我们将不得不开始重新配制疫苗,或者至少考虑这个想法。”(生物谷

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